���. ���������: |
||
19-Sep-2000
|
��� ��� ����, 16(4), �������-��������� 1999, 356-367
���������� �������
�������� ���������� ��������
������� ���������
��� ������������ ��������������� �� �������� ����� ���������
�� ����������� ���������� �������������� ���������*
�. ��������������,1 �. ���������,1
�. ���������,1
�. �������,1 �. ������,2 �. ������1
1���������� ����������-������������,
������� �����, ������������ ������
2����������������� ����������, ���������� ������������
������ ������
��� �������� ������� ���� � ���������� ���� ������������ ������� ��� ��
��������� ��� �������� ��� ����������� ��������� ��� �� �������������
�������� �������������� ��������� ��� ����� �������������� �� ��������.
� ������� ���� �� ��������������� ��� �� ����������� ���������� ������������
����������, ������������ ��� ����� ��� Crohn. ������ ����������: ����� ��� Crohn, �����������. |
� ��������� ����� ��� ����� ���, ��' �,�� ��������, ��������� ���� �� ��� �������.1,2 ����������� ��� 100 ������ ���� ��� ��������� ��� ��������� ������� ��� ��� Koch, � ����� ��������� ��� ������ �� �������� ������ ��� ����������� ���������. ������������ ��� ����������� �� ��� ����� ��� ��������� ��������� ��� ��� ����� ��������� ��� �� Mycobacterium tuberculosis, ��� 90.000.000 ���������� ����������� �� ����������� ���� ������� ������ 1990� 1999,3 ��� �� ����� �� 30.000.000 �� ����� ����������.4 �� ������� ��� ����������� �������� ����������, � ������, �� ����, ���� ������ �� �������� ��������� ��� � �������� ������������������ ���������, ��������� ������� ����������� ���� �������� ��� �����.5 ����� ���� ��� ��� ��������� ��� ������������� ������������ ��� �� ��������������, ����� ������ ��� ���� ����������� ��� �� ��� ���� �������� �� �������� ���������������, �� �����������6,7 ��� �� ���� ��� Crohn.8
� �������� ��� ����������, ����� ��� ������, ��������� ���� �������� ������� ������� ������ ��� ������������. � ��������� ������������� �� � ������� �������� ��� ����������� ���������� ��� ������ ���� 100 ��������/mL ���������, ��� ��� �� ��������� ��� ���������� ������� �������� 3�7 ���������.9 �� �������� ���� ������������ ��� ����� 2�3 ���������, ���� ��������� ��� ��������� �� ���������� ��� ���������� ������� ��� ��� ����������� �� ������� ������.10 �� �� ������� BACTEC, �� ��� �� ����������� ������� �������� ��� ��� ����� ��������� ����� ��������� ��������� (15�22 ������),11 ��� ��������� �� �������� ��� ������������� ��� ��� �������� ������������ ������ ������ � �������������, ��� ��� �������� �������� ��� ������� ������, ���������������.7 � ������� ������������ �� �� ������ Ziehl-Nielsen ������� ������������� ����������� � ���� ��� 10.000 ���������������/mL ���������12 ��� ����������� ���������� ��� ���������� ��� 22�78% ��� �������������� �� ����������� ������������,7 ��� ��� ��������� �� �������� ��� Mycobacterium tuberculosis ��� �� ���� ���������������� ����.13 ��� ��� ��� ������ ����������� ��� ������� �����������������-���������� ��� ��� �������� ��� �������������� ��������������� (Gene Probe, San Diego, California, SNAP system, Syngene Inc, San Diego, California), � ���������� ���� ���� ����� �������� �� ���� ��� Ziehl-Nielsen ��� ��� �� ���� �����, � ����������� ���� �� ������� ����� ����� ������������.14
�� ��� ������� ������ ���������� ��� ����������� ����������, ��� ��������� ���� ��������� ��������� ��� ����������� (polymerase chain reaction, PCR) ��� ��������� ��� �������� ��� ����������� ��� Mycobacterium tuberculosis complex (M. tuberculosis, �. bovis, M. bovis BCG, M. africanum, M. microti), Mycobacterium avium complex (M. avium MAIS2, M. avium serovar 7, M. avium WP M21, M. paratuberculosis Linda, M. paratuberculosis C286, M. paratuberculosis ATCC 19698) ��� Mycobacterium paratuberculosis, �� ��� ��������� �������� ��� �� ����� �������������� �� ��������. � ���������� ���� �������� ��� �������� �������� ����� ��� ������ ����������������� ����� �� ������ �������� ���������, ��� ��������� ������ �� ������ ����������� ������������ ����������, ������������ ��� ����� ��� Crohn.
����� ��� �������
�����
�� �������� �������� ��� ������������, ������������ ����������� �� ������������ �������� ����� ���������������, ���� ��� �� DNA ��� ����������� ��� ������� �����. ���� ��� ������ ����� ���� �� ���������� ��������� ������� ������� ��� �� ����������� ������ ������� Shropshire (Shropshire Veterinary Investigation Center) ��� ������� ���������, ��� �������� ����������� ��� ������������� �������������� ��� ���������� DNA (���. 1).
����� ��� ��������, � ������������ ���������� ����������� ��� �� ���������� �������� ����� ��������������� �� �������� (���), ��� ����������� ����������, ������������ ��� ����� ��� Crohn. �� ����� ���� ����������� �� �������� ������:
����� �: ��������� ����� �������� ��� ���������� ��� ����������� �� ������ ����������� ��������� ���������� �������������� ��������, ������� �� ���������� ����������. �� ����������� ����� ����������� ������ �� �� ������ Ziehl-Nielsen, ��� ���������� ����� ��� �� ������������ ����������� ��������������� ��� ��� �����������. �� 35 �������� ��� �� �������� ������ ������������ � �������� ���������� ������� �� �� ������ Ziehl-Nielsen, ��� �� 39 ����������� �� ����������� ������������ ��������� ��� ��������� ���������������.
����� �: ������ ����� �������� ��� ���������� ��� ����������� �� ������ ����������� ��������� �� ���������� �������������� ��������, ������� �� ���������� ������������. �� ����������� ����� ����������� ������ �� �� ������ Ziehl-�ielsen, ��� ���������� ����� ��� �� ������������ ����������� ��������������� ��� ��� �����������. �� ������ ��� �� �������� �������� ��� ������������ �������� ���������� ������� �� �� ������ Ziehl-Nielsen, ��� ��� �� ����������� ������������ ��� ��������� ��� �������� ���������������. �� �������� ��� ������ ����� ����� ��������� �� ����������������� �����, ��� ������� ������������ �� ����������� ������������, �� ������������ ��� ������ ������������� ��� ��� �� ������ ��� ��������� ��� ��������� �� �� ������� ������� ��� ������������� ���������.
����� �: ������ �������� ��� ���������� ��� ����������� �� ������ ����������� ��������� ���������� �����������, ������� �� ���������� ����� ��� Crohn. �� ����������� ����� ����������� ������ �� �� ������ Ziehl-�ielsen, ��� ���������� ����� ��� �� ������������ ����������� ��������������� ��� ��� �����������. ���� � ��� ��� ��� � ���� ������� ��� ��������� ��� �������� ���������� ������� ��� ���������������, ����������.
����� �: ������� �������� ���, ��� ����������� ��� ���������� ����������� ������� ��� ������ ����������� ������� ��� ��� ����������� �������������. ��� �� ����������� ���� �������� � ��������� �������� �������� �� ����� ��������� ��� ����������� ��� ������� �������� (30), ��������� ������������� (10), �������� ������ (4) ��� ������ ������� (6). �� �������� ����� ��� ������ ����������� ������� �/��� ���������� ������ ��� ����� ��� ������ ����������. ��� �� ����� ����������� ��� �� �� ������ Ziehl-Nielsen, ��� ��� �������������� ����������� ����� ��� ����������� ������� ��� ��������� ����������, ��� �������� �� 22, ��� ��� 30 �������� �����������, ��� �������� ���������������.
�������
������� DNA. �� �������� 2 mL ������������� 2�3 ����� ��������� ������ 10 �m. �� ����� ���������� ��������� �� ������ 60 oC, ������� �������� ��� �������� 75%, ��� ��� ����� ������������� ���. �� ������ ��� �������� ����������� � ������� ��������, ���� ��������� ��� � ������� ����������� �� ������������ ���������������, �������� �� SDS ��� ���������� � ��� ��������� ����� 50 oC ��� 30 min ��� 12 ����.16 ��� �� ������� �������������� �� ������������ ��������� �� ��� ������� �� ������� ��� ��� �������� �� ��� �� �������-�����������-���������� �������. �� DNA ��������������� �� �������� ��� ��������� �� 50 �L ����� ��������� ����� ��������������.16
������������� �����������. ���� ������� ��� Mycobacterium tuberculosis complex ��� ����� ������� ��� Mycobacterium avium complex ��� M. paratuberculosis ���������� �� ��� ������ ��� �������������� �� 7H9 Broth �� Middlebrook ADC Enrichment Bacto, �� �������� ��� 2 mL �� ������ ������. ��� ������ ��� �� ������� ����� ��� ������ ��������������� ��������� ���������, ��� ��� ������ � ��� ����� ��������������� ��� ��������� ������� ���������� ��� 600 nm ��� � ���� ��� ��� ������������ colony forming units (cfu)/mL ���������� �� �� ������ Miles-Misra.15,17 ���������, ������ ��� ��������� ������� ����������� ��� ��� ������������ ��� ��������� ��� ��������� ��� ����������� DNA,18 ���� �� ������� ������������ ��� ��� �� ���. �� ���� ����� ��� ��������� ��� �� ������19 �������� DNA/������� ���������������, ����� ��� ���� �������� ������������� �����������.
������������� �����������. ��� ��� ������������ ��� �����������, ���������������� 10 �������� ��� ��� ��� ����������� ����� ���������� �������� ��� ���� �������� �� ����������� ��� �� �� ������ Ziehl-Nielsen. � ������������ ������� ����������� ������ �� ������� ���� ���������������, ���� ��� �� ��������� ������������ ���� (Rhodococcus, Corynebacterium, Nocardia, Actinomyces, E. coli). �� ���, ����� ��� ������������ ����������� ��� �������� ��������, ���������������� ��� �������� �������������� �� ������� ���� ���������������, ����� ������ ��� ������� �����.
��������� ��������� ��� �����������. �� �����������������-���������, ��� ���������������� (���. 2), ������������ �� ���� �� ������������ ��� ��������, ���� ���� ���� ����������� �� ���������� �������� (Genbank). ��� ������� ���� �������� ������������ ������� �������� ��� ��� ������ ��������������� ��� ������ �� ��������������, �� �������� ���� �� ����� �����������, ���� �� ��������������� � ���������� ���� (NCBI BLAST Search). �����, �� �� ����� ������� ���������� ������������, ��� ��������� �� ������ ��� �������������� ��� ����������� ���������, ����� � ������ ���� �������� ��� �������������� � �������� ����������� ����������� (OLIGO 5).
Mtb1 ��� 2: ���� �� ������ ��� ��������� �������� ��� ������� �������� 243 ������ ������ (��), ��� ���������� ��������� MPB64, ��� ����� ������20 ��� �� Mycobacterium tuberculosis complex.
Mtb1(184�197): 5�-GCT CTG TTG TTC GGG TGT GGC CA-3�
MTb2 (404�427): 5�-GAT ATT CAA TTC GTA GGG GGC TT-3�
MAC1 ��� 2: ���� �� ������ ��������� �������� ��� ������� �������� 91 ��, ��� �� �������� ������� IS1110,21 ��� ����� ������22 ������������ ��� �� M. avium complex ��� ��� ��� �� M. intracellulare.
MAC1 (1353�1370): 5�-CAG GCA GAG GGT GGC CG-3�
MAC2 (1427�1444): 5�-CGA ATC ACC CCC GAT CA-3�
�16SD2 ��� M16SU: ���� �� ������ ��������� �������� ��� ������� �������� 509 ��, ��� �� ������� 16S rRNA ��� M. intracellulare, ��� ����� ������ ��� M. intracellulare, M. avium, M. paratuberculosis, �. smegmatis ��� M. gordonae.
�16SD2 (68�93): 5�-GTG GGC AAT CTG CCC TGC ACT TCG G-3�
M16SU (481�668): 5�-GCC CGC ACG CTC ACA GTT AAG CCG T-3�
� ���������� ��� PCR ��� ������������, ���������������� �� �� ������ hot start,16 �� ������� ����������� Perkin Elmer 9600. ���� ���������, ��������� ����� 50 �L, �������������� �� 50 mM KCl, 10 mM Tris-HCl (pH 8,4 �� ����������� ��������), 1,5 mM MgCl2, 0,25 �� ��� ���� �����������������-��������, 200 �� ��� ������ ��� �� ������� ������������������������ (ATP, TTP, CTP, GTP), 2,5 units Taq �����������, 0,05�0,1 �g DNA, ���� ����� �������������� (HPLC) � ����������� ���������. ��� �����, � ��������� ����������� �� ����� �������� ����������� (mineral oil). �� ������������� ������ ��� ��������������� ��� ��� �� ���� ����� ��������� ������������, ���� ��� ������ ������ ����� 94 oC ��� 10 min, ��� ���������� ����� 62 oC ��� 0,5 min, �������� ����� 72 oC ��� 1 min ���, �����, ���������� ����� 94 oC ��� 0,5 min. � �������� ��� ����� ���������� �������������� �������� ��������������� ��� 30 ������� ��� �������������, �� ��� ������ ����� 72 oC ��� 7 min.
��� ������� ��� ������ ���������� ��� ��� ������� ������ ������� ������������� ���� ��� ��������� ��������� ��� ����������� ������ �������� (��������� ���������, carry over effect23), � ������� ������ �� ������������ ���� �� ��������� ��� ��������-N-����������� [UDG (GIBCOBRL)].
�� ������ ��� ����������� PCR ��������������� �� ����� �������� 2%, ���� ����� ���� ��������� ��� ��������� �������. �� ������������ DNA �������������� �� film Polaroid �� ����� �������� ���������� ����� (���. 1).
��� ��� �������� ������ ������� ������������� ���� ��� ���������� ���������, ������� ��� �������� ��� ����������� ������� ��� �������� (20% ��� ������� ��� ���������), ��� ����� �� DNA ���� �������������� ��� ���� (��������� ��������). ����� �����, ��������������� ��� ���� ������� ��� �������� ��� ��� ����� ������������� �� ���������������� DNA (������� ��������). ���� �� ����� ��� ��� �� ������� �������������� ���� �� �� ���� ������� ��������, ���� ��� ��������� ��� �������� �����������, �� ����������� ������ ��� ����������� ��� �� ������. ���� � ����� ������� ������� ����������� ��� ��� ����������� ��� ������ ���������� ������� (internal control), ��������� ��� � ��������� �� ������ ���� ���� �� ������ ���� ��� ��� ������������� ��� �����������. ������, ������ ����������� �����������������-��������� ���������� ����������� ���������� ���� �������� ��� ��������,24 � ����� ���������� ������� �� ���������� ��� ���������� ��� ������������� ������������.
��� ��� ������� ��� ����������� ������ ������� ������������� ���� ��� ��������� ������������ ��������������� ��� ���� ��� ����������, ��������������� ���� ����� �������������� � ����������� ���������. �������, ��������� ��� �������� �� ��������� �� ���� �������� ��� ����� ��� ��������������� ���� �� ���������� ��� ������������� ��� ����� �� ��������, ���������������� �� ��������� �������� ��� �������� ��� �������� �� ��������������.
Southern blotting
��� �� ���������� ��� ����������� ��������� ��� ��������� PCR, ��������������� ������ ����������� �����������������-���������� ��� ������ ��� �� ���� �������� DNA. � ���������� �������� �� ���������������, ���� ��� � ������� ���������� ��� ���������������, ����� ���� ��� ������������ ��� ���������� ��� ECL (ECL detection system Amersham International plc, Amersham Place, Bucknghamshire, England).
����� ���� ��� ������������ ����������, ��� ����� ����� �� ����������� ����� ��� �������� ���������� ��� ��������� DNA ��� �������� �� ���� ������ ���������, ����������� ��� ���� ����������, � ������ ����������� �� ��� ������������ ������� ��� ����������� ��� ���������� ��� �� ����� ������ ��������� (�16SD2 ��� M16SU). � ���������� ����� ����������� �� ���� ��� ������ ������� ��� �������� ����� ��� �� M. paratuberculosis ��� ����� �� ���� �� ��������� ���� �� ����� ��� �� ������ ��� ����� (M. intracellulare, M. avium, M. paratuberculosis, �. smegmatis ��� M. gordonae) ��� ������������ ��� �� �������� ������ ���������.
PRAVMPAR (132�161): 5�-GGA TAG GAC CTC AAG ACG CAT GTC TTC T-3�.
������������
����������
� ���������� ��� ��� �� ����� ��������� ����������� ��� �������� ��� ��� 10-4�10-5 cfu/mL, ��� ������������� ����� ����� ��������������� �� �������� ��� ��� 10-6 cfu/mL ��� ����� ������������ ���������������. ��������� ������� ���������� ��������� ��� �������� ���� ������ ��� ��������� ����� ������������ ��������������� 1:1500 �� ������ ��������� 0,001 OD ��� 600 nm. � �������� �������� DNA, ��� ������� ���������� ��� �� ������ �� �������� ������� �� ����������� ����������, �������������� ��� 50 fg, ��� ����������� �� 10 ��������������,19 ��� ��� �� ��������� PCR ��� Southern blotting �� ��� ��������� PRAVMPAR, � �������� �������� �������� ��� 5 fg (1 ������������ �������).
�� ���� �� ������� ����������� ������������ �������� ������� ������ ������� �������������, ��� ������������� ��� ������ ��� ����� ��������� ��� �������� ���� ������� ������������. � ����� ����� ����� �������������� ��� ��� uracil DNA glycosidase, �� ��������� �� �� ����������� ����� ���������� ��� ��������� ���� �� �������� ��� ������� (������� ����������� ��� ������� ��� ���������� �� ���������� ����� ����������� ���� PCR, ����� ������������� ������, �������������), �������� ���� �� ��������� �������� �� ������ �� ����������� �������� ����������.
����������
� ���������� ��� ������������� ������� ����������� �� �� ���������� ��� ����������� ���, ���� �� ����������� ��� ���� ����� �� �� �������������� ���� ����� ������� �� �� �������� ��� ���������� ����. ��� �� ����� �����, ���� ���� ��� ���������, ���������������� ������������ �������� ����� ����������� ��� ���������������. ��� �� ������������ ��� ��������� (���. 1), ����������� � ������� ���������� ��� ���������, ���� �� ������� ������ ��� ��� �� ������� ������.
�� ������ ��� ��������� Mtb1�2 ��������� �� ������ ������ (98,59%, 70 ��� ������ 71) ��� ����� ��� ������� ��� Mycobacterium tuberculosis complex (���. 1), �� �������� �� ��� ��� �� ��� ������� M. africanum, ��� ��� ��������� �� Mycobacterium tuberculosis complex, ���� ��� ���� ���������� ��������������� �������������. �� ��������� MAC1�2 ���������� �� 82,5% (33 ��� ������ 40) ��� ����� ��� ������� ��� Mycobacterium avium complex (M. avium MAIS2, M. avium serovar 7, M. avium WP M21, M. paratuberculosis Linda, M. paratuberculosis C286, M. paratuberculosis ATCC 19698). �� ��������� M16SU-D2 ���������� �� 100% (25 ��� ������ 25) ��� �������� Mycobacterium avium ��� �. intracellulare ��� �� 100% (15 ��� ������ 15) ��� �������� M. paratuberculosis, ��� ��� �� 7 ������� �. gordonae ������������ ���� 4 ��� ��� 13 �. smegmatis ���� �� 10. �� ��������� �� ��� �������� ��� ��������� DNA �������� 509 ��, ��� ��������� ��� ���� ����������� ���������, � �������� ��� ��������� PRAVMPAR ��������� �� 100% ��� �������� ��� ������ M. paratuberculosis.
������� �����
��� �� 75 �������� ��� ������ �, ��� ��������� ���������� ���������� ���������� �������������� ��������, 59 (79%) �������� ������ �� �� ������������ ������ (���. 3). ��� ����, 38 �������� (50,6%) �������������� �� Mycobacterium tuberculosis complex, 7 (9%) �� Mycobacterium avium complex, ���, ����� ��� �� �����������, ������� ��� 14 (19%) ��� ���������� ������ ����� ��������� M16SU-D2, ����� ������ ��� ���� �� ����� ������ ��������� �� ��� ��������� PRAVMPAR. �� ��������� ����� ���������� ��� ���� �� 14 �������� ������ ���� ����� M. intracellulare, M. gordonae, M. smegmatis (���. 2). ��� �� ������ ��� 35 Ziehl-Nielsen-������� ���������, ���� �� 31 (86%) ���� PCR-������, ��� ��� �� 39 ������ �������� �� ��� ����������� ���� ��� PCR-������ (���. 3). �������� �������� ���, �� ��� ��� �� ����� ����� ��� ������, ��� ������������ ������ �� �����������, ���� ������ ������ ��� �� ��� ������������ ������, 4 ��� �� Ziehl-Nielsen-������ �������� ���� �������� ���� PCR. �� ������������ ���������� ������������ �� ��� ��������� ��� ��� ������� ��� �� ����� ����������� ������� ��� ��������� ��������.
��� �� 25 �������� ��� ������ �, �� ����������� ���������� �� ���������� �������������� �������� ������� ������������ ������������, 6 (24%) �������� ������ �� �� ������������ ������ (���. 3), �� ����� ��� �������������� �� Mycobacterium tuberculosis complex. ��������, � ����������� ��� � Ziehl-Nielsen ��� ������ ������ ������ ����������.
��� �� 20 �������� ��� ������ �, ��� ������������ ��� �������� ����� ������� �������������� �� �������� ��� ����������� ��� ����������� �� ������ ����� ��� Crohn, �� 7 (35%) �������� �������� ����������� � �������� ����������������� DNA �� ���� ��������� MAC1�2 ��� M16SU-D2. ��� ���� �� ��������, 2 (10%) �������������� �� Mycobacterium avium complex, ���, ����� �����, ������� ��� 5 (25%) ��� ���������� ������ ��� �� ���� ��������� M16SU-D2 (���. 3). �� ������ ��� 9 ��������� ����� ������ ��������� ��� �� ��� ��������� PRAVMPAR, ������������� ���� �� �������������� �� M. paratuberculosis. ����� ��� ��� ����� �������� ��� ���������������� (Ziehl-Nielsen ��� �����������) ��� �������� �� ����������� ��� �������� ������������� (���. 3).
�� �������� ��� ������ � (���. 3) ������������� 30 ������� ��������, ��� �� 22 ��� ����� ��� ����������� � ����������� ����������������� ���������� (BAL) ��� ������� �������� ��� �������� Mycobacterium tuberculosis, ������� ��� ������������ ��� �� ��� PCR. � ��������� ���� �������� ��� 4 ����� �����������, ��� ��������������� �� Mycobacterium a vium complex. � Ziehl-Nielsen �������� ����������� �������� ���� �� 16 ��� �� ������ ��� 22 ������������. �������� ������ PCR, ������������ ��� Ziehl-Nielsen ������ ��� ��� 6 ��� �� 10 �������� ��������� �������������, ��� ����������� ������� ��� ��� ����� ��� 22 ������������ ������������, ��� �� ����� ���� ����� ��� � ������� ������. �����, �� ��� ��������� ��� ��� 4 ��� �������� ������ ��� �� 4 ��� ��� 6 ��� ������ ������� (��� �� 6 ����������� ��� ��� ���� ������ �� ������ ����� ��� Crohn), � PCR ����������� ��� �������� Mycobacterium tuberculosis complex.
��������
�� ��������� ������, � ���������� ������ ��� ���� ��� �������� ������� ��� ���������� ���� �������� ��� ���������� ���� ���������� ������� ������������ �����������, ��� ���������� ���� PCR ��� ������������ �� ������� ��������.25�29 �� ������� ����� ����� ������ ���������� ��� �������� �� ������� ��������, ��������� ��� ������������� �� ������ ����� �������� ���� �� Southern blotting � ��� DNA ���������. ����� �����, ����, �� ���� ��� ����������� ���������� ����� ��� ��������� ��� Mycobacterium tuberculosis complex � ��� Mycobacterium avium intracellulare complex, ����� �� ������� � ���������� ��������� ������������ �����������. �������� �������, ��� ����������� ��� ��� �������,31�33 ��� ���������� ���� ��� ����� PCR, ���� ��� ����� ������������������-����������, ������������ ��� ���� �������� ��� ��������� ���� ��� ���� � ��� ����� ������ �������������, ��� �� ������� ����������� ���������� ���������� ��� ����������� ���� �� ���� ��� Ziehl-Nielsen.14,27 �����, �� ��� �� ������ ���� �������� ������� ���������, � ����� ���� �������������� ���� ��� ������������� ����������.
����� ��� �������� �������������� ��������� ��� ��� ����� ��� �� ���������� ������� �� ����������, � ������� ������ ���������� ���� ��������� ��������� �������, ��� ��������� �� �������� ����������� ���������� ��� ���� ������������ ����������, ���� ���������� ����� �� ��������������� ������� ���������������. � ���������� ��� ������������������-���������, ��� ��������� ������ �� ���������� ���� ���� ����� �������������� ��������, ��������� �� ���������� ������� ���� ��������� �� ����� ������ ���� ���������, ����������� ������ ��� ����������� �������� ��� �������� ����� ��� ������ ���� ���������� ���������������, �� �������� 12�24 ����. � �������, �������, ��� �������� 16S rRNA, ��� ��������������� ��� �� �������� ��� PRAVMPAR ��� � ����� ������������ ��� ����� ����, ������ �� ��������� ��� �� �������� ���������� ���������� ��� �� �������� ������ ��� M. intracellulare, M. avium complex, M. smegmatis ��� M. gordonae. �����, ���� � ������� ����, ��� ��� � ����������� ������ ��� ��������������� ������ ��� ����������������� ��������� (���������, �����������, ����� ��� Crohn) ����������� ��� ����� ����.
���� ������� ������ ����� ������� ������� ������������� ��������-������ �� ���� �� ������ �������������� ����, ���� ��� �� �������� ��� �������� �������������. ����� �������������� ��� �� ����� ��� ��� ����������� ������������ PCR ��� ��������������� � ������� IS6110, �� ��� ��������� ��� ������� �� � ����� ��������� ��������� ������� ��� ��� ��������� ��� Mycobacterium tuberculosis complex.34�36 �� ����� ��� �������� �� ���� ��� ������� ���� ��� � ������� IS6110 ������������� �� ������� ����������� ��� �������� ������� ������ ������� �������������,30,38 ��� ���� ���������� ��� ������� ����� ���������� ��� ������� ��� Mycobacterium tuberculosis complex.38�40 �� �������� ����� �������� ��� ������ ��������� ��� ���������� ��� ��� �� ������ �� ��������� ������ ������������ ��� ���� ��� IS6110 �� �� �������� ����� ���������� ��� ������������� ������ ���������������.38 � ����� ��� IS1110 ��� �� �������� ��� Mycobacterium avium complex �� ��������, ���� ��� ��������������� ��� ��������� �����������, �� �������� ������ �������� ������������. �� ��� ������ ����������� �� ��� ��������� ������ ��������,41 ����� ������� ��������� �� ����������� ���, ��� ���� �� ������� �����������, ���� ��� �� ������� ��� ������������ ��� ��������.42 ��� �� Mycobacterium avium complex, ����� ��������������� � ������� 16S rRNA,19 ��� ��� �� M. paratuberculosis, ����� ��� �� ����������� �������, �� ��������� ������ ��������������� ��� � IS900 (���. 4), � ����� ��� ��������� ��������� ������ �� ���� �� ����� ���������������.43 � �������� ��������� ��� ��� �������� ����� �������� �� ����������� �������� ���� ��� ��� �������� �� �������� ���� �� �� ����� ��� ������� ������������������-���������. �� �������� ��� ���������� � ������������ �������, �� ����� ������� ���� ����������� ��� ��� �� ���� ��� ���������� ��� �� �� ������ ��� ��������� ��� ���� ��������� �� ���������� ��������, ���� � ����������� ���������� �������� ��� ������� ��� ���� M. gordonae ��� M. smegmatis. �� ��� �� ��������� ���������� ��� �� ������� �� ��� ������� ��� IS900 ���� ��� �������� 16S rRNA, � ���� ���� ��� ����������, ����� ��� �� �������� ��� ��������� ��� �������� ��� M. avium ��� M. intracellulare. �� ��������� MAC1�2 ���������� ���� 8 ��� �� 15 ������� M. paratuberculosis (���. 1), ������� ��� ������� ��� � ������������� ��� ��������� IS1110 ��� ����������� �� ��������� ��������� ��� �� ��������� ����������� ��� �� ������� ��� �������� ������. �������, ����� ���� ��� � ����� ���������� ��� M16SU-D2. �� ��������� ����� ������������ ���� 10 ��� �� 13 ������� M. smegmatis ��� 4 ��� �� 7 M. gordonae. ��������, �� ��������� ��� ������������ ��� ��������� ������ �� �������� ����������� ��� ������������� �����, ��� ��� ����� ������� ��������� ����������� ����������. � ����� �� ���� �� ����������� �������� �� ������ ���� �� ���������� ��� ����� ������� ���� ����������� ��� ���������� ���������� �������� ��� �� �������� ���� ���������������.
������������ ��� ���������� ��� �������� ������� �� ����� �������� ��������� ��������������� ���������� ���� PCR � ��� ��� DNA ���������, ������������� ��� �� ������� ����������� ���� ����� ��������� �������������. ��� �� ����� ������� ������ � ������������� ���������� ��� � ���������� �������� ��� ����������� ��� PCR, ��� ������������ ��� ��� Ziehl-Nielsen, � ������������� ����������� ����� �� �������� ��������. ���� ���� ��������� ��������� ��� ��� ���� ����� ����. � ������ �� ������ ����������� ������ �� ������ ��������� �������,44,45 � ��� �������������� ��� ������� ������ ���������������, ������� ������� ��� ����� ��� �������� �����������, ��������� ��� ����� ���������� ��� ����������� ��� ������������� �������� ��� ����� ���� �������� DNA ��� ������. � ���������� ����, ��������, ����� ���� ����������� ��� ��� ������� ���� �������������� �������������.
�� ���� ��� �������� ���������, ������������ �� ���� ��� ����������� ��� � ���������� ��� ������������ ������� ��� ������������ ���� ��������� �� �������� ��� ��� �,�� �� ������� ������������. � �������� ��� ������ ���� ��� ������ ��������� ��������� ������ �� ������������ �������� ��� ��������������� ��� ������, ��� ������ ����� �� ��������� ��� ���������� ��� �������. ���� ���� ��� ����� ������, ����� ���� ��������� ��� ��������� �������, ��������������� � ��, ����� ��� � �������� ������� ��������� ���������� DNA (��� ���� ������ ��� �������) ��������� �������� ��� ���������.46
�� �������� ��� ������ ������� �������������, ��� ���� ����������� ��� ��� ������,47,48 ���������� ������ ��� ��������� ��������� (carry over effect). �� ������� �������, � ����� ����� ��������� ����� �������������� (HPLC) ��� ��� ������� UDG, �� ��������� �� �� �������������� ����� ����������, ���� ��� ������������ ����� �������������� ���� ������������ ����� ��� �����������.
� �������� ������ ��������� ������������� ���� ������������ ����������� ��������� ���� ������ ���������� ��� ���������� ��� ������� ����� ��� ������������� ��� ������� � ���� ���� ����� ����������� ��������������� �, �����, ���� ���� �������� (�������������� � ����������) ��� DNA. �� ���������� ��� ���������� �������� ��� ����� ��������� ���� ���� ��������� ��� ������ ��� ����� ������������� �� ��������, �� ��� �� ���� ��� ��������� ��������� ������������ ��� ���� ����������� �������� � ����������� �������� ��� ���� �� ����� ���������, ���� ���������������, DNA, ��� ����� ���������� ��� ����������� ������������� ��� ����� ���� ��������.49 ��� �� ���� ����, �� ���� ��� ����������� ��������� ����� ��� ����������, � �������� ��� DNA ��������� �������� �� ��� ������������� ��� ��� �� ��������� ������� ����������.
���� ���� ��� ���������, � ���������� ��� ������ �������� ���� ��� ��� �������� ��������� ����� ���������� �� �� �����, ����� ��� ������� PCR, ��� ����������� �������� ������������, ��� ������ Ziehl-Nielsen ���, ���� ���� ������, ��� ������������.
�� ������� �������, ������������ ��� ��� ����� �� ������ ������ ��������������� � �������� ��� �������� ������� ���� �������������. ����, ����� Ziehl-Nielsen-������, �� ���� ������ ��� ����������� ������������ ��� PCR-������. �������� ��� ��������� ���������� 4 ���� �������� (���. 3, ����� �), ��� �� ��� ���� Ziehl-Nielsen-������, ������������ PCR-��������. � ����������� ���� �������� ��� PCR ��� ������ �� �������� ����������, ��������� ��� ��� �� ����� ��������� ��� ����������� ��� ����������� ������ ��� �� �����������, ������ ������� �������� ������ ������������ ��� PCR (���. 3). � �������������� ��������� Ziehl-Nielsen ��� PCR ��������� ������� ��� ��� �� PCR-�������� ������� ���� ��������� �� ������� �� ���� ��� ������������ ��� �� ������ � ��� ���� ��������� ��� ��������� ���������� ��� ��� ������ ��� Mycobacterium spp.
��������, �� ���� ��� ����� ����������� � Ziehl-Nielsen �������� �� ����� ��������� ���� ���������� ��� ��������� ��� ��� ����� ������ ���������, ����� �� ��������� ��� �������������� ��� ��� ������� ��� Mycobacterium tuberculosis complex. ���� ����� �, � Ziehl-Nielsen ��������� ����� 22 ��� �� 37 PCR-������ �������� (���. 3), ��� ����������� ��� ��� ��� ����� ��� 33 Mycobacterium tuberculosis complex PCR-������� ���������.
�����, ��� ��������� ���������� ��������� ��� ������� �� ��� ���������� ���������� ��� ��������� ��� �������������� ��� �������� �� ������ ����������. �� ��� ���� ������� ������ � ���������� ����� ��� ��������� ������������ ���������, �������� ��� ��� ������� ��� ��� 30% ��� �� �������� ����, ��� ���������� ��������� ������� ���������� ����������, ��� ������ ����������� �������������� �� ����� ������ ��� �� ����������� (Ziehl-Nielsen, �����������, PCR). �� ��������� ������ ������� �� �������� ���� �������� ���������� ��������� ����������������� DNA � ����� ��� ���� ������� ��������������� ��� ������� ����������. � ���������� ���� ����� ���������, ����� �� ������ ����������� ���� ������� ����� ������������ � ������ ��������� ���� �� ���� ��� ���������� ������, ���� ���, ���� ��������, ����� �������, ��������� ��� ����� ��������� ��� �� ����������������� � �� �������� ���������. ��������, ������� ��� � ��������� ������������ ��� ������� ����������� �� ��������������, �� ����� ���������� PCR-������ ���������� ���� ��� ��� ����������� ����������� ����������.
��� ������� ��������� ����������� ���� ��� ������ PCR ��� ������������, ����� ��� �� ���� ��� ��� ������� ��� Mycobacterium tuberculosis complex. �������� (���. 3) ���� ��� �� ������� ����������� � ����������� ��� �������� ������� Mycobacterium avium complex ��� Mycobacterium paratuberculosis. �� ���������� ����, ����������� ��������� ��� ������� ��������, ���� �� ����� �����������, ��������� ��� ������������� ��������� �� ����������� ��� M. paratuberculosis. ���� ����� ��� Mycobacterium avium complex, � ��������� ���� ����� ���������� ������ ��� ������� ��������� �������������� ����� ��� ������, � ����� ���� ����������� ��� ��� �� ����50,51 ��� ����� ���������� ������ ����������� ������� �� ��� �������� ����������� ������������ ��� �������� ���.
��� ����� ��������� ������ ���� � ��������, ���� ����� �, 6 ������������ ������� �� �������� ���������������. �� ��� �� ��������� ������ �������� ��� ��� ������������ �������� ��� ������� ������������ ��� ��� ������� ��� ��������������� ���� ��������������� ��� ������������, �� �������� ����� ������ ����������, ��������� ������ �� �� �������� ���� ���������������. �������� �������� ��� ����������� ������������ �� Mycobacterium avium complex, ���������� ��� DNA ��� Mycobacterium tuberculosis complex ��� ���������� �� ������ ��� ���� �� �����������,45,52 ��� ����� ���� ������ ������������� ������� �� ��������, ���� �� ��������,5,53�55 ��� ��� �� ������������ ��������.56,57 �������, ���� ������������ ��� �����, ������ ��� �� �������� ����������� ��� ����� ������� �� �������������� ������������, ������� ������, ���� ���� ��� �������� ��� ������, �� ����������� �������������� ������ ������ ��������� �������.
���� ������� ������, �� ��� ����� ������� ���������� ��� ��� �������� �������� ��� Mycobacterium avium complex ��� ����������� ��� ����������� ������������, ��� ���������� ������ ��� �� ������ �� ���� �� �����, ���, ��������, �������� 6 ��� ������ ��� Mycobacterium tuberculosis complex. �� �������� ��������, �� ��������� �� �� �������� ��� �������� �������������, ���� �� ������������� ��� � �������� ������������� ��� ��������������� ��� ����������� ��� ����������� ����� ���������� ��� �,�� ������ ���� ���������. ��� ����� ���������� ������, ��� �������� ��� �� ������ ��� ������������� ����� ��� ���������� ��� ���������, ����� ��� ��� �� 6 ��������, ����� ������� ������������� ��������������, ������ �� ��� ����� 8 ������ ��� ����������� ����� ����������� ��� ������ �������� ��� ������������ (����������������, ����������������� �������, ������������). ��������, �� �������� 17 �����, ��� ����� ��� ����������� ��������������, ����������� ���� �������� ����������� ��� ��������. �� ������ ����, �� ��� ��� ������ �� ����������� ���� ��� ������ �������� ��� ���������, ������� ��� ������ ���������� �������� ������� �� ����� ��� ���������� ��� ������� ��������� ��������� ��� ��������������� ��� �������� ��� ������������. �� ���������, �������, ������ �������� ��� �� ��� �������� ������������ ����� ��� ��� ����������� �������������� �������� ����������� ������������ �� ��������� ������������� ��� ������������������ ������.43
��������� ���� ��� ������� ������������ (���. 4) ������� ��������� ��� �� �� ���� ��� Crohn. ��� �� 1932, ��� � Boril Crohn ���������� ��� ���� �� �������������� ����������, ����� �������� ���������, � ����� ���� ��� �� ����� ���,58 ��� ���� ����� ������ � ��������� ��� M. paratuberculosis �� ������ ��� �����, �� ��� �������� ��� �������������� �������� ��� �� �������� �� �� ������������ ����� ���������������.59,60
���� ������� ������, ������������ � �������� M. paratuberculosis (���. 3, ����� �) �� ������� 35% ��� ������������ ��� ����� ���������� ���� ����� �������� ����� ��� Crohn. ���� ����� �, ������������ � �������� ��������������� �� 4 ��� ��� 6 ������� ������� ��� ����� ������ ��� ������ �� ������ ��������� ��������. ���� �� ����������� �������� ��� ���������� ���������� ���������� �������� �� ����������������, ��������� ��� ���� ��� ��� �������� ��� PCR �� ����������� ���� ����������� �� ��������� ����������. ��������������� ��� ������, ������������ ��� ��� ������ ���������� ��������, ��� �������� �������� ��������� ����. ���� �� ��� PCR ������������ � ������� ��������������� ��� ������ � ������ ����� ��� Crohn, ���������� �������������� ��� ������������. � �������, 15 ����� ��������, ��� ���������� (������� ��� ������������) ���������� ���������, ��� ���� ��� 6 ����� �������� �������������� �� ��������� ��� �������� ������������ ��� �������������. �� ��� ���� �� ������ �������� �� �� ������ �������� ��� ������������� ��������������� ��� ����, ���� ��� �� �� �������������� �������� ��� �������� ������������ ������������� ��� ������������ �� ��������� ������������ ��� ��������������� ��������, �������� ���������� ��� �� �� � �������� ���� ���������� ��� ����������������� ��������� ��� ������������ � ��� ���������������� ������, ��� ����� ��� ���� ������������.61
��������������, � ������������
����������� ���������� ������ �� ���������� ��� ����, ��������� ��� �������
���� ������������ ��������� ������������, ��� ����� ������� ������ ��������
���������������. � ��������� �������� ��� ������� �� ����� �������������� ��
�������� ��������� ���� ���� ��� ������� ��� ���������, ��� ������ �� �����
�� ����� ������ ��� ����� ��� ������ ����� ������ ���������� ����������. � ����������,
�����, ������� ������������ ��������������� �� ����������� ����������, ������������
��� ����� ��� Crohn, ��������� ��� ����� �������� ������� ���������, ��� ������
�� ��������� ��� �������� ���� ��� �� ������� ���������� ������ ��� ����� ����������
��� ���� �� ��������.
������������